做blast有什么意义 blast意思

所谓blast既是:basic local alignment search tool 局部序列比对基本检索工具,在ncbi上分为多种,常用的有n-blast(核苷酸序列比对检索)和p-blast(蛋白比对检索).此外还有primer blast等,这个你到ncbi上可以自己看下.blast的作用顾名思义,就是用于各种核苷酸序列,蛋白质序列等在数据库内与已知数据的比对检索,可以找出相似的序列,用于蛋白质和核酸等的功能结构预测分析.

blast英 [blɑ:st] 美 [blæst] n.爆炸; 一阵(疾风等) (吹奏乐器、哨子、汽车喇叭等突然发出的) 响声; 突如其来的强劲气流; vt.击毁,摧毁; 尖响; 裁判高声吹哨; 枯萎:使枯萎; vi.爆炸; 吼叫; 枯萎:枯萎; 攻击:严厉批评或猛烈攻击; [例句]The blast caused extensive damage to the house. 爆炸给这所房子造成了大面积的损坏. [其他]第三人称单数:blasts 复数:blasts 现在分词:blasting 过去式:blasted 过去分词:blasted

1. 引物设计前blast比对,提醒下这是一个错误的认识,因此,要区别同源比对和验证比对,在对感兴趣的基因设计引物时,用的是同源比对,就是把物种上”近亲“的某个基因序列进行blast alignment,然后找出他们的保守片段,或者保守区间,在保守区间内设计引物,通过PCR扩增出来的成功率较高.这就是意义.2. 设计引物的步骤:a-同源比对找出保守区或片段,将保守片段复制出来保存为fasta格式;b-NCBI有个primer-blast,输入你复制出来的序列,然后设置你需要扩增的片段长度,点击提交按钮就可以得到候选引物;c-使用primer premier,详细方法网上很多,不再敖述

生物信息学中的blast有两层含义:一方面,它是指一种快速的局域序列对位排列算法,在这方面与FASTA齐名;另一方面,它是指实现这个算法的软件.这个软件是由NCBI编写的(www.ncbi.nlm.nih.gov).目前,由于blast的强大功能,如果我们把传统生物学实验称为湿实验,而将生物信息学分析成为干实验,对应的blast在生物信息学中的地位,与分子生物学中的PCR实验基本等同.如果要详细地了解blast,可以到www.ncbi.nlm.nih.gov/blast转一转.

得到新蛋白质肯定是要知道其序列吧,用blast查找一下.至于的得到信息,1,确定有哪些已知直系或旁系同源序列;2,确定这种蛋白质有没有在特定物种中出现,便于好研究;3,确定这个蛋白质序列身份;4,确定这个蛋白质有没有哪些变种

Blast的运行方式是先用目标序列建数据库(这种数据库称为database,里面的每一条序列称为subject),然后用待查序列(query)在database中搜索,每一条query与.

Blast比对结果中,Score得分值越高说明同源性越好;Expect期望值越小比对结果越好,说明因某些原因而引起的误差越小;Identities是同源性(相似性),例中所示比对.

blast |blast| noun1 a destructive wave of highly compressed air spreading outward from an explosion : they were thrown backward by the blast.• an explosion or explosive .

先到:130.14.29.110/BLAST/index.shtml选择Nucleotide-nucleotide BLAST (blastn)然后在Search旁边那个大方框里填你要寻找的序列,然后点BLAST!然后按Format!这时会弹出一个新的窗口,慢慢等个十几秒几十秒……出来的结果会将找到的序列按是否接近排列出来.点最左边一栏(例:gi|114690489|ref|XR_025388.1|)的话会给你看找到的序列的详细介绍,而如果点Score bits下面的数字就可以看见你输入的序列和他们在数据库找到的序列的对比.上面Query一行是你输入的,下面Sbjct是数据库里的序列.

有个选项就是[Distance tree of results],点击选择后出现一个距离树 找到你的目标序列支系之后,在相应的节点上悬停鼠标,弹出一个选项菜单,选择“show Alignment”就有序列信息了.