Gromacs计算速度慢耗时太长怎么办？(［讨论］如何加快计算速度)

• ［讨论］如何加快计算速度
• symsum()计算速度太慢怎么办？
• 怎样提高ansoftmaxweii求解速度
• gromacs怎样进行REMD的计算

［讨论］如何加快计算速度

如果不能改变硬件条件的话，建议你改变一下编译器如果用Intrl编译器的话，效率比liniux自带的编译器高不少

symsum()计算速度太慢怎么办？

用Maple或者Mathematica试试，还慢就只能寻求数值方法了。 查看原帖>>

怎样提高ansoftmaxweii求解速度

时间设置短一点，步长大一点。不过要根据你实际需要来设定，拿电机来说，比如你要看损耗，那时间就得长一点了 ；如果看反电势，设置一个周期的时间就行，也方便FFT分析。

gromacs怎样进行REMD的计算

Gromacs没有图形化界面，你需要的是给一套分子坐标，并告诉Gromacs计算的参数，就会得到结果。结果是一组坐标，需要用分子可视化比如PyMol来看。因此，Gromacs并不像Windows程序那样打开来使用的。

关于Gromacs的用法，你可以在其（）找到一些教程，也有用户手册，里面有命令的解释。